En dicho centro surgieron una serie de acusaciones entre representantes de los partidos ARENA y FMLN. Los del primer instituto político señalaron el traslado de personas de otros municipios para que fueran a votar a Tapalhuaca, pero miembros del FMLN dijeron que lo ocurrido tuvo que ver con problemas de actas y sellos.
Tras el cierre, el magistrado del Tribunal Supremo Electoral, Miguel Ángel Cardoza, dijo que la Fiscalía tuvo que intervenir y a eso de las 3:00 de la tarde la fiscal electoral informó que ya se había resuelto el problema y que el centro de votación fue habilitado para que los votantes pudieran ingresar y votar.