Reportes periodísticos citaron a la familia del exasesor, quienes recibieron una llamada de la Fiscalía de San Marcos para notificarles el deceso.
Según la esquela de muerte del Instituto de Medicina Legal, publicada por Revista Factum, la causa de la muerte del exasesor de Bukele fue un edema pulmonar cuya causa está pendiente de determinar.
El reconocimiento del cadáver de Muyshondt Álvarez fue hecho a las 8:10 de la noche del miércoles 7 de febrero, según consta en el documento y el cuerpo entregado a mediodía de este jueves.
Jorge Alejandro Muyshondt Álvarez fue detenido el 9 de agosto del año 2023, tras la publicación de audios e imágenes de una supuesta conversación que vinculaba al diputado de Nuevas Ideas, Erick García, con posible tráfico de drogas, lavado y nepotismo.
El miércoles 23 de agosto, la Fiscalía acusó a Muyshondt Álvarez en el Tribunal Sexto contra el Crimen Organizado de San Salvador por los delitos de revelación de hechos, actuaciones o documentos secretos por empleado oficial y de favorecimiento de la evasión. La audiencia fue realizada el 25 de agosto donde decretaron reserva total del caso.
En octubre reciente, luego de una serie de rumores sobre la muerte del exasesor de Seguridad, la Fiscalía publicó un video donde mostró a Muyshondt Álvarez mientras era notificado de una audiencia de revisión de medidas. Quince días antes de esto, El Diario de Hoy informó que el exfuncionario habría sido hospitalizado a inicios de octubre, debido a un supuesto accidente cerebro vascular, pero esta información no fue oficializada.
En noviembre, el abogado de la familia de Muyshondt, Fernán Álvarez, solicitó a la Sala de lo Constitucional de la Corte Suprema de Justicia (CSJ) que admitiera un habeas corpus y ordenara una revisión médica, física y mental, en favor del exfuncionario, con el fin de conocer si era apto para enfrentar el proceso en su contra.