Estas son las decisiones que toma con mayoría calificada o cuatro votos:
- Nombrar a miembros de las Juntas Electorales Departamentales, Municipales y organismos que intervienen en el proceso electoral.
- Nombrar a funcionarios y personal en el TSE.
- Suspender total o parcialmente las elecciones por un tiempo necesario ante "graves alteraciones del orden público" en municipio o departamento.
- Conocer y resolver todo recurso, petición o incidente.
- Declarar firmes los resultados del escrutinio definitivo de las elecciones presidenciales, Asamblea Legislativa, Parlamento Centroamericano y concejos municipales.
- Aprobar el presupuesto del TSE.
- Aprobar proyectos de reforma a la legislación electoral para ser presentados a la Asamblea Legislativa.
- Aprobar el reglamento interno para aplicar el Código Electoral.
- Aprobar contratos de suministros o servicios del TSE. Puede delegar a un magistrado el otorgamiento de los contratos.
- Conocer y resolver peticiones de nulidades de elecciones y de escrutinio definitivos.
- Trasladar, remover y sancionar a funcionarios y personal del TSE.
Por mayoría simple, el TSE puede decidir:
- Autorizar a un magistrado para que reciba la protesta constitucional de Juntas Electorales Departamentales o representar al TSE en actos específicos.
- Autorizar la licencia de magistrados.
- Resolver consultas de organismos electorales.
- Imponer multas a infractores.
- Requerir del Órgano Ejecutivo medidas para cumplir sus funciones.